燕窝与粗纤维食物相克，如与芹菜、油菜、莴苣等富含粗纤维食物同食，不利于营养物质的吸收稱利用。燕窝与红霉素、四环素相克。因服用红霉素、四环素等药物，不宜食用富含钙的食物，而燕窝含钙丰富，钙能与红霉素、四环素结合，降低药物的疗效。忌食用生燕窝或未炒熟的燕窝。因燕窝为雨燕科动物金丝燕及多种同属燕类用唾液与绒羽等混合凝结成的巢窝，在形成过程中难免混有各种杂质，甚至细菌、病毒和寄生虫，若食用生燕窝或未炒熟的燕窝，很容易患病。