秋季吃最好。首先秋季燕子食用的东西较多，此时筑出来的巢穴，其唾液中的营养也较为充足，燕窝的营养成分也最为丰富;其次燕窝的主要食疗功效是滋阴润肺，而秋季正是干燥、肺虚咳嗽较多的时候，吃点燕窝刚好滋补身体，润肺止咳，故秋季吃燕窝相对其他季节而言更好。

食用燕窝的最佳时间是：在临睡前，或是饭前、饭后两个小时食用会更宜人体吸收。儿童、妇女和年长长辈，可以在早上5点至7点之间食用，有助于调养。一些肺部有病痛或咳嗽的人，在凌晨一两点或半睡半醒之间吃下，效果会更好。