有些黑色杂质是羽毛，燕窝里面的毛是金丝燕的羽毛，羽毛中的成分主要是蛋白质。但是，羽毛是不可被消化的纤维，即使吃了也无害，是会被排出体外的。

燕窝的处理方式如下：

毛燕先泡在水里3分钟，同时用牙刷慢慢的整盏刷一遍。然后拿上来，放在密封盒子里30分钟后，用精密度高的镊子除去粗细毛，然后再水洗，放在滤网中（可以刷或搓捏）绒毛就很容易掉出来，再放到白色的瓷盘中，细小的绒毛就很容易可以被挑出，再用滤网在水中淘洗干净即可。

干净的燕窝买回来后泡发后，用手将燕丝分开，里面若有黑点和细毛，把燕窝放在大的盛器中加水后用手捏捏燕丝，把水倒掉（燕毛会浮上来所以不要用滤网），再次清洗时已经没有燕毛可以用滤网在比较大的盛水器中晃动燕窝中的杂物就会出来了。