即食燕窝杀菌锅采用的正是微波杀菌，一般罐头食品厂对罐头作常压水煮加热杀菌处理时都采用这种杀菌方式，通过引入压缩空气可实现反压杀菌，如冷却需在锅内进行，须用水泵打入锅顶部的喷水管（或采用水循环系统）。即食燕窝杀菌锅主要从控温精度和热分布均匀性上进行选择，若产品要求温度很严格，尤其是出口产品，因为要求热分布很均匀，所以应尽量选择电脑全自动杀菌锅。电脑半自动杀菌锅温度控制、压力控制与电脑全自动相同，但是价格却是电脑全自动的1/3。一般要求可以选择电气半自动杀菌锅。手动杀菌锅杀菌难度高，控温和控压等都由人工完成，食品外观很难掌握，涨罐（袋）和破碎率高。在杀菌时，由于加热使罐头温度升高，罐头内压力会超过罐外（在锅内）的压力。因此为了避免杀菌时玻璃瓶罐内增压而跳盖，对罐两端面凸出必须施加反压力，特别是对需要较高杀菌温度的肉类罐头更就如此。