燕窝底座是粘在石壁或者木板的地方，是比较厚而密实，牢牢地撑起了整个燕窝。就如我们盖房子一样，经常这样认为先把地基打好，才能盖很高的房子。由于担负着使燕窝更稳固的作用，金丝燕会在这里吐出更多唾液，质地也相对较坚硬。底座是燕窝与石壁或木板的衔接处，因此刚采摘的燕窝底座上也会夹杂着一些木屑、沙子或者泡沫，有些人为了美观也会稍微一下。刚采摘的燕窝底座本来就是厚而密实的，因为是燕窝承重部位。不同的挑毛加工工厂工艺手法不同，所以成品的燕窝底座也就不同。手法好的挑完毛后底座的囊丝能保持不变，保留了自然的厚底座。有的挑毛工厂，为了保证燕窝的盏型，干脆直接把囊丝修剪掉，就变成了薄底座或无底座燕窝。