燕窝原料的霉味比较明显，一来是因为金丝燕喜欢潮湿的环境，部分燕农会在燕屋中安装加湿器，令燕屋中的湿度适合金丝燕居住，令燕窝原料的霉味更浓。二来是燕农在采摘燕窝时，会在燕窝上洒水，采摘燕窝时才不容易令燕窝受损，因此燕窝原料的霉味会更浓。干燕窝闻起来也会有轻微的霉味或淡淡的腥味，是因为燕窝中含有水分，零售燕窝的干度较高。燕窝原料采摘后，会经过浸泡、挑毛、风干等多重加工工序，燕窝当中的氨水味大部分会因此被浸泡和挥发掉。如果是没有经过浸泡和挑毛的毛燕，氨水味会更重一些。

如果炖好的燕窝味道有很浓的腥味或胶味，这就有可能不是天然纯正的燕窝。