干芡实的存放位置应该是阴凉、干燥、通风较好的地方。干芡实含有丰富的淀粉，所以在贮藏过程中注意防止其受到虫蛀。防止虫蛀的方法可以是在晒干的干芡实中加入几瓣生大蒜防虫害。

是每千克芡实放入8~10瓣生大蒜，与芡实拌匀后装入缸内盖严，这样可以保持芡实在一至两年内不受虫蛀。

芡实最好能密封保存，并置于通风干燥处，防蛀。芡实由于含大量淀粉，在储存中极易遭虫蛀，如果将芡实与生大蒜按20:1的比例，把生大蒜瓣用纱布包好放置于装好芡实的容器内，即可产生良好的防虫效果。

而新鲜的芡实在常温下最多只能保存3~4个小时，这是因为芡实在在拨开后有很多水分，放在常温下，会蒸发水分，产生变色并且发出馊味。

所以最好的方法是将不用的新鲜芡实放到冰箱冷藏室冰冻起来。通常是拿一个真空的袋子均匀地装入1：1的清水和芡实，封好放入冰箱的冷藏室中速冻起来，下次用的时候解冻出来还是新鲜的。