泡发好的燕窝，必须用布把燕窝中的水份挤干，需要用密封保鲜盒收好。放入冰箱冷冻格且防生水防油可存7天，放在冷藏格中48小时内必须炖煮，所以要尽快食用完。

在我们燕窝原产地，浸过水的燕窝必须在36小时内风干。燕窝是水溶性蛋白质，含水的燕窝会溶化。泡在水里的燕窝会容易导致细菌滋长变质。新鲜燕窝不合适泡发后放在普通保鲜盒，燕窝会吸收冷藏格中其他食物的味道，食物的味道会影响燕窝的原味。此外，因为燕窝是高蛋白质的食物容易因为潮湿滋生细菌或其他原因变质甚至软绵。